《國色芳華》里秦勝意背叛牡丹,重新回到王擎身邊,她還將牡丹的秘密告訴了王擎,使得牡丹慘遭陷害,被流放到軍營,成為一名官奴,大家都很好奇牡丹是怎麼出的軍營,蔣長揚當時為什麼不及時出現救她。
牡丹沒有想到秦勝意會被王擎的花言巧語所矇騙,她被京兆府抓走之前讓大福趕緊送走徐祭酒,以免被官府發現。在大堂之上,王擎將他與秦勝意的婚書交給牡丹看,還說是秦勝意將她的事情透露出來的,就是想霸占花滿築,牡丹自然不相信秦勝意會是那種恩將仇報的人,肯定是王擎威脅了她。
秦勝意不想連累蔣長揚,於是認罪伏法,被貶為官奴,發配到了軍營,每天受盡虐待和毆打。這個時候蔣長揚正巧去了洛陽,對牡丹的事情一無所知。之後,徐祭酒找到了芸娘,托芸娘把長安的事情告訴蔣長揚,讓蔣長揚去軍營把牡丹救出來,這長安和洛陽相距甚遠,一時半會到不了,所以牡丹還得再軍營遭受苦難。
牡丹對草木頗為熟悉,還積累了豐富的藥理知識,為了不被當成活靶子,她就跟士兵們搞好關係,故意下藥讓士兵吃壞肚子,然後再把提前準備好的草藥分給他們服用,化解了這場危機,從那之後,牡丹就成了士兵口中的神醫。
縣主派人陷害牡丹,結果被啞女聽到,她拚死把消息傳遞給了牡丹,牡丹才得以化險為夷,躲過一劫,可惜啞女卻死了,令人心痛。緊接著,收到消息的蔣長揚趕到軍營,然後買下牡丹,就這樣牡丹的戶籍攥在蔣長揚手裡,有了蔣長揚保護,沒有人敢輕易動牡丹,這也是為了她好,兩人最後走到了一起。