《長河落日》是一部以第二次世界大戰中的中國為背景的歷史戰爭劇。
武木一郎費勁心思，終於成功將威特陳帶離三灶島，帶回了上海，然而最後還是功虧一簣。
上海三井公館一直在調查武木一郎的身份，武木一郎和威特陳剛出機場沒多久，就被日本軍方以保護的名義帶上車。
武木一郎只能是利用軍統和日本人在街上起衝突，想要趁亂帶著威特陳離開。
遺憾的是最後還是失敗了，威特陳為避免暴露，選擇了引爆隨身炸彈，在最後他把任務託付給了武木一郎。
原來威特陳的任務是在衢山的機場，為轟炸東京的美國軍機提供信號接引，確保安全降落。
這是一個緊急新建的機場，一個日本人不知道的機場，美國軍機將在這裡完成補給，然後前往東京。
從威特陳自爆的衝擊中醒來的武木一郎立刻起身返回三灶島，因為密電之前讓葉碧瑩背了下來。
他要完成威特陳的任務，就必須把葉碧瑩帶出來，同時他還要救下三灶島上的島民。
然而這一次回三灶島，他面臨的局面更加兇險。經過這一系列的衝突後，大島浩已經咬定武木一郎有問題，他只是沒有證據。
而原本選擇相信武木一郎是天皇特使的藤田司令，也開始出現動搖，讓人暗中監視武木一郎。
武木一郎有自己清晰的計劃，他要把葉碧瑩和大島浩都帶走。
只要以配合調查大角岑生案為藉口把大島浩帶走，島上居民就可以暫時安生。
藤田作為駐軍司令，治理手段是溫水煮青蛙，不像大島浩那麼暴烈，不會太為難島上居民。
不過當務之急，還是要阻止大島浩組織的捕魚活動，他計劃在海上搞大屠殺，將三灶島青壯年都殺死。
然後再安排開拓團上島和剩下老弱婦孺混居，如此一來三灶島的下一代就都是日本人了。
武木一郎潛入了藤田司令的辦公室，拿到了相關計劃文件，拍照後傳給了澳門安瀾堂。
安瀾堂在沈處長的幫助下，召開了新聞發布會，把消息散給了各國媒體，媒體齊聚海上拍攝。
最後大島浩只能在藤田的命令下，終止了海上屠殺計劃。
可惜的是在衝突中，葉龍俠被大島浩擊斃，而文件的泄露也讓藤田開始支持大島浩調查武木一郎。
關於海上大屠殺的計劃，總共只有兩份文件，最有可能泄露的就是藤田手裡的那一份。
因為大島浩已經確認，葉家一直通過信鴿和安瀾堂互通消息。
這件事情的確認，讓藤田把武木一郎的皇宮密信交給了大島浩，讓他去做調查。
藤田的要求很簡單，如果查出問題，可以說密信是他給的，如果查出沒有問題，那就大島浩自己背鍋。
然而藤田沒有想到，大島浩不講武德，在晚宴上直接拿出了密信，要求武木一郎當場給皇宮發電，證明自己的身份。
大島浩這麼做，一來是他的身份根本沒有渠道查不到皇宮，二來是要捆綁藤田司令。
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{nextpage}只是他都沒有想到，武木一郎的身份和任務都是真的，這才是武木一郎最大的「底牌」。
他甚至都沒有告訴軍統沈處長，也沒有告訴上海地下組織的同志。
被大島浩拉下水的藤田氣急敗壞，當場免去了大島浩警察大隊隊長的職務，對武木一郎換上了一副諂媚討好的嘴臉。
接下來武木一郎只需要構建好邏輯鏈，就可以把葉碧瑩和大島浩一起帶走。
藤田為了向皇宮證明自己的忠誠，這一次一定會全力支持，和大島浩做切割，大島浩的小聰明反而成了他的催命符。
如此武木一郎就能完成威特陳任務的同時，徹底解除大島浩對三灶島居民的威脅。
只不過大島浩就是一條瘋狗，他同樣可以意識到自己的處境，而越是到了窮途末路，他越是瘋狂。
而三井公館也通過屍體，確認了威特陳是美國人的身份，還查到了歌舞廳是軍統據點，也就查到了葉碧瑩的身份。
留給武木一郎的時間不多了，魚和熊掌不可兼得，恐怕還會有人犧牲。